Con estudios de Composición en la U. de Chile, además de piano, violonchelo y contrabajo, Muñoz provenía de una familia de abundantes músicos, con abuelos folcloristas, madre cantante y guitarrista, y padre chelista y compositor. Fue, también, alumno de órgano de Miguel Letelier, Premio Nacional de Música 2008. Luego, sus estudios más decisivos de acordeón tuvieron lugar en San Bernardo, con el gran acordeonista Ignacio Hernández, en el Conservatorio Nacional de Acordeones de Chile.

Esa historia nueva había comenzó para Joaquín Muñoz en 2012, a los 20 años de edad, impulsado por su abuelo materno músico. Pronto comenzó a tocar con el elenco de cueca brava Los del Mapocho, además de probar en músicas del folclor ruso, con el conjunto Kalinka. Muñoz se adentró en el mundo de los fuelles, teclados y botoneras, hasta alcanzar niveles de virtuoso. Ha obtenido premios y menciones en concursos y certámenes en Canadá, Italia, Argentina y Chile, y entre esos logros su nombre figura como el primer acordeonista chileno en participar en una categoría de música docta a nivel mundial.

Intérprete del acordeón clásico (que permite la polifonía entre ambas manos, emulando al órgano de iglesia) y del acordeón standard (ideado para acompañamiento), Muñoz ha sido también profesor y gestor de proyectos como la Fundación Entre Fuelles, el Festival Internacional de Acordeón que se realiza en Chile y la citada Orquesta Nacional de Acordeones de Chile. Y entre sus trabajos como músico aparecen discos como Acordeón a la chilena (2019), con obras contemporánea para acordeón solo y electrónica mixta de compositores como Andrés González y Felipe Pinto D'Aguiar, y Clásicos de ayer & hoy (2020), donde reobserva canciones del repertorio popular universal.